在成功化解幻梦星系团的能量危机并与古老文明建立初步友好交流后，联盟与古老文明的合作进入了实质性阶段。双方都意识到，彼此的知识与技术互补性极强，携手合作有望揭开宇宙中更多的奥秘，推动文明的共同进步。
联盟派遣了一支规模更大、学科更全面的科研团队进驻幻梦星系团。这个团队涵盖了物理学、生物学、天文学、量子科学等多个领域的顶尖专家，旨在与古老文明展开全方位的合作研究。同时，古老文明也通过特殊的能量信号传输方式，向联盟分享了部分他们的科技知识和对宇宙的认知。
在物理学领域，古老文明的科技资料为联盟的科研人员打开了全新的视野。他们发现古老文明对能量的理解和运用远超联盟现有的水平。古老文明掌握一种名为“灵能”的能量形式，这种能量不仅能够跨越空间进行瞬间传输，还能与物质进行深度的交互，实现物质结构的精确重塑。
科研人员们对“灵能”展开了深入研究。他们在神秘天体附近建立了专门的“灵能”研究基地，利用古老文明提供的技术指导，尝试捕捉和解析“灵能”的特性。经过无数次的实验和观测，他们发现“灵能”的产生与一种特殊的量子场有关。在这个量子场中，粒子的行为遵循着一套与传统物理学截然不同的规律。
为了更好地理解和利用“灵能”，科研人员们开始研发能够与“灵能”进行交互的设备。他们借鉴古老文明的设计理念，结合联盟自身的材料科学和工程技术，制造出了一种名为“灵能共鸣器”的装置。这种装置能够通过调整自身的量子频率，与周围环境中的“灵能”产生共鸣，从而实现对“灵能”的收集和初步操控。
在生物学方面，联盟科研人员与古老文明共同对幻梦星系团内独特的生命形式进行研究。他们发现，除了之前发现的基于能量场生存的生物外，还有一些生物能够在极端的能量环境中进化出特殊的适应性。例如，在一个靠近神秘天体的行星上，存在着一种晶体生物。这些生物的身体由一种特殊的晶体构成，这种晶体能够吸收和储存大量的能量，同时还具备自我修复和进化的能力。
通过对晶体生物的基因序列和生理结构进行分析，科研人员们发现了一种全新的生命进化机制。这种机制与传统的基于基因变异的进化方式不同，它更多地依赖于外界能量环境的刺激。在高能量环境下，晶体生物的晶体结构会发生微妙的变化，这种变化会反馈到基因层面，促使生物进化出更适应环境的特性。
联盟的生物学家们希望能够将这种发现应用到联盟各星系的生物科技发展中。他们设想开发一种新型的生物治疗技术，通过模拟晶体生物所处的能量环境，刺激生物体的细胞进行自我修复和进化，从而治疗一些目前无法治愈的疾病。